除常规课程外,两院还积极开展各类学术交流活动,每年组织上百场学术报告会和二、三十场国际学术会议,为博士研究生提供了各种学术交流的平台。从2013年起,厦门大学王亚南经济研究院携手德国洪堡大学成立International Research Training Group (简称“IRTG”)联合博士项目。该项目由双方院校每年分别在全球招收5名博士研究生,进入项目的学生按规定分别在厦门大学和洪堡大学学习一段时间后,由在双方导师联合指导,在符合相关要求后可同时获得厦门大学和洪堡大学的博士学位。目前,厦门大学录取的第一批“IRTG”项目5名博士生即将在2014年9月赴德进修。