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西南大学生命科学学院研究生导师谢建平介绍如下:
谢建平,(1971-),重庆永川人,博士,研究员 (微生物学、细胞生物学、细胞微生物学,分子医药和分子免疫学、分子遗传学、微生物与生化药学、计算生物学等方向),博士生导师(微生物学、细胞生物学)。现代生物医药研究所副所长,重庆市统计分析中心副主任,《遗传》副主编。
联系电话:023-6825 3392(实验室),023-6836 7108(办公室)
电子邮件:georgex@swu.edu.cn; jianpingxiefudan@gmail.com
QQ:2412263711
教育经历
1989.9-1993.7 西南师范大学 生物学 学士
1996.9-1999.7 复旦大学 微生物学(分子遗传学方向) 硕士
1999.9-2002.7 复旦大学 微生物学(分子免疫学方向) 博士
2009.1-2010.1 新泽西医学院与牙科学院(Rutgers University) 公共卫生研究所 全球结核病中心 国家留学基金委资助 访问学者
2011.2-2011.3 约翰霍普金斯大学 国家留学基金委资助 高级研究学者
2012.7-2012.8 康奈尔大学weil医学院微生物与免疫学系 国家留学基金委资助高级研究学者
2015.3- 2015.4 美国宾夕法尼亚大学医学院 国家留学基金委 高级研究学者
2016.2-美国宾夕法尼亚大学医学院,国家留学基金委高级研究学者
工作经历
1993.07-至今 西南师范大学(2005年与西南农业大学合并后改称西南大学)任教。其间,1993.07-1996.08 任西南师范大学学生政治辅导员,助教;1996.09-2002.06 在复旦大学定向攻读硕士和博士研究生,先后任讲师(1999-2001),特聘副教授(2001.1-2003.5),2003年6月职务破格由讲师晋升研究员,2006年5月被聘为博士生指导教师。2003.5-2008.5任生命科学学院副院长(分管科研、学科建设和研究生,期间生科院获得生物学一级学科博士学位授权点和生物学博士后流动站)。
主要学术兼职与承办的全国性学会学术活动、荣誉
重庆市微生物学会副理事长、海外华人微生物学会理事会成员、《遗传》副主编,《微生物学报》第十届编委(2011-2016),《药学学报》第十二届编委,中国微生物学会普通/分子微生物学/干扰素与细胞因子/教育专委会委员/噬菌体学组副组长;中国遗传学会微生物遗传/产业促进专委会委员;重庆市遗传学会常务理事,中国免疫学会会员,重庆市免疫学会常务理事;中国毒理学会毒素毒理专委会常务委员;中国药学会高级会员。2006年4月26-28,在西南大学成功承办了两年一届的“第六届中国青年微生物学工作者学术研讨会”。2012年10月12在西南大学成功举办了第五届全国青年微生物遗传学会议。2014年6月27-30在西南大学主办“组学时代微生物学”国际学术研讨会。
2005年9月获得重庆市高校中青年骨干教师称号,2008年获得重庆市人事局和组织部颁发的微生物学后备技术人才称号,2010年国务院政府特殊津贴获得者,2011年教育部新世纪优秀人才计划入选者。
评审专家:国家自然科学基金委、国家科技部国际合作项目、教育部学位论文/长江学者评估、教育部国家留学基金委项目通讯评审专家、南非/韩国/波兰/荷兰等国的科学基金,河北省科技厅、江苏省科技厅、浙江省科技厅、四川省科技厅、苏州科技局
学术刊物审稿
Nature protocols, Microbiology, Journal of Microbiology and Biotechnology, 日本传染病杂志(Japanese Journal of Infectious Diseases),plos one,Tuberculosis,gene, J proteome Research, FEBS lett, BMC系列,scientific reports等几十家SCI刊物的审稿人。
科研主要方向
微生物致病分子机理和新药研发。集中在结核分枝杆菌等人类重要致病菌的致病耐药分子机理和新疫苗/药物等干预措施、新诊断技术与方法的研究与开发;重要工业微生物关键代谢产物分子调控的系统生物学研究;酵母等基因工程药物产生菌表达系统的构建和应用研究;结核菌与宿主相互作用的分子机理和基于信号传导的新药物靶标鉴定、新药物筛选模型构建与应用研究。主要利用系统生物学和系统生物技术、转录组学、代谢组学、定量蛋白质组学、表观遗传学等功能基因组方法学、分子免疫学、细胞生物学、合成生物学、计算生物学等前沿和新方法,促进对重要致病菌的生物学本质认识和转化医学研究。
作为主要研究人员或者项目负责人先后承担国家十一五重要传染病科技重大专项“结核病药靶研究”和“结核菌快速诊断技术和产品研究”,国家973项目“重要病原菌防治基础研究”,“基于生物信息学的新型药物靶标的鉴定和功能研究”,国家科技攻关“耐药结核病防治措施研究”,863项目“新型酵母表达系统研究”,国家自然科学基金项目“定量活细胞成像技术研究分枝杆菌噬菌体感染周期的关键分子”,“促旋酶上位相互作用在耐药中的作用”,“多聚磷酸外切酶在分枝杆菌生物膜形成中的功能”,“结核菌Rv0621基因的功能深入研究”,“上位相互作用在结核菌促旋酶氟喹诺酮类药物耐受中的作用机理研究”,“严紧激素的实时检测和信号传递研究”,“光合微生物产氢的物质能量转化研究”,教育部重点课题“结核分枝杆菌持续感染分子机理研究”,新世纪优秀人才资助“结核菌持续感染的转录因子调控网络”,重庆市重点攻关课题“基于转录组和代谢组的紫杉醇高产菌株筛选和应用研究”,国家外专局“春晖计划”,海外名师项目3项等。获得上海市科技进步三等奖“耐药结核菌诊断技术研究”。重庆市自然科学三等奖“结核病防控新措施的基础研究”(2014).先后以通讯作者发表SCI论文120余篇。部分开创性工作获得美国科学院院士、麻省理工学院教授James Collins的高度评价。多次应邀在国际性学术会议和清华大学医学院、中国科学院等口头报告。2002年7月,应邀在法国巴黎第10届国际细菌学和应用微生物学大会(国际微生物学联合会International Union Of Microbiology Society, IUMS,每三年一届)上作口头报告。2004年应邀在“2004首届国际后基因组峰会”上作关于“耐药结核菌的比较蛋白质组学研究”的口头报告、2004年6月应邀在“第三届海内外神经科学中青年国际学术会议”等会议上口头报告其工作。2006年3月在中国药学会主办的“中国医药领域的知识产权保护学术研讨会”上作“基于生物序列的新型药物靶标产业化研发的知识产权保护”大会报告。2009年加拿大第26届国际抗生素与化疗会议等。2012年中国资源微生物会议(成都),2012年青年遗传学家论坛(昆明),2013年首届放线菌大会(上海),2013年中国微生物学教学与产业化会议(南京),2013年国际结核病耐药会议(北京),2013年中国遗传学大会(哈尔滨),2014年全国遗传学理论与实践教学研讨会,2014年组学时代微生物学国际研讨会(重庆),2014年第一届噬菌体国际会议(南京),2014年 第六届全国微生物遗传学学术会议(温州医科大学)。2015年美国纽约州首府Albany世界结核病日学术研讨会,2015年7月25日,第十五届微生物学教学与科研产业化研讨会(新疆师范大学),2015年8月16日,2015中国遗传学会大会微生物遗传分会场报告(昆明),2015年8月22日,重庆市和湖北省微生物学会联合会议(湖北恩施),2015年9月26日,内蒙古大学生命科学学院遗传学教学研讨会(内蒙古呼和浩特),2015年10月11日第十二届全国生物毒素与医药应用大会(延安大学),2015年10月25日《药学学报》药学前沿研讨会(天津),2015年10月26-28中美抗生素耐药与食品安全国际会议(上海),2015年11月15日,广州“高校生命科学课程教学系列报告会(2015)(第十届高校生命科学课程报告论坛)”分组报告“微生物学、细胞生物学和遗传学相关课程的整合教学模式探索”,2015年11月15日“全球结核病防控新措施基础研究进展与反思”(中山大学生命科学大学院),2015年11月23-25日国家自然科学基金委国际合作局“中英抗生素耐药双边研讨会”,2015年11月26日“结核病分子机理研究与新药筛选”(第二军医大学药学院)
国际性的研究生培养
课题组研究生培养理念:全球眼光、以“发展壮大民族生物医药产业&健康社会”为己任、富有团队、创业和创新精神、既是一流劳动者也具有全球战略视野的 “技术+社会+经济金融+管理”复合领军型人才。已经完成和正在与国际一流大学联合培养的博士生名单:冀磊(美国约翰霍普金斯大学公共卫生学院微生物与分子免疫学系,结核菌持留菌研究),周培富、李武(加拿大University British Columbia医学院,结核菌激酶信号传递研究),杜庆林(美国康奈尔大学Weill医学院,结核菌调控宿主趋化因子表达的分子机理研究),邓万燕(美国宾夕法尼亚大学医学院免疫学),谢龙祥(美国Rutgers大学新泽西医学院公共卫生研究所全球结核病中心)。
博士研究生龙泉鑫2011年获得美国微生物学会资助参加在美国芝加哥召开的第51届抗生素多学科会议,在全球40名受助者中他是大陆唯一获得资助的人员。龙泉鑫在毕业一年后,主持获得国家自然科学基金委青年基金资助,研发结核菌新的遗传改造工具。博士生段湘科2015年4月获得国际结核病疫苗基金会资助参加第四届世界结核病疫苗大会。
目前1名留学生在课题组攻读微生物学专业博士学位(2013-2016)、1名攻读硕士学位(微生物与生化药学2014-2016)。自2006年开始,几乎每年指导2-4名美国本科生到实验室进行暑期科学研究。
研究生在读期间,根据其研究业绩将至少参加一次全国性学术会议。目前在读的硕士以上研究生受到训练后,基本都能够根据自己的研究课题方向,独立英文写作并发表2-3篇两分以上的SCI论文。研究生将基于自愿承担一系列的国际专家学术接待任务。实验建立了从微生物到细胞的,包括生物安全二级实验室的一系列研究平台。
研究生招生、主要研究方向与培养:
招生层次、专业及方向:博士 专业一:微生物学方向:药用(工业)微生物功能基因组学与新药筛选模型 专业二:细胞生物学 方向:细胞信号转导与药物靶标研究
硕士:专业一:微生物学 方向: 药用(工业)微生物功能基因组学与新药筛选模型专业二:微生物与生化药学 方向:药物微生物功能基因组学与新型药物筛选
主要研究方向描述:
(1)结核分枝杆菌等重要致病菌相关的功能基因组学与治疗措施研究&产业化开发,主要涉及新型药物作用靶标的鉴定、高内涵(high content screening,HCS)药物筛选模型与创新药物的研发、治疗性疫苗、细胞微生物学、免疫分子遗传学、代谢组学和系统生物学研究、药学细胞生物学,分枝杆菌噬菌体基因组学,基于噬菌体的纳米(分子)医药和新抗生素研发等;翻译后修饰、表观遗传在结核菌持留中的作用和新药物靶标筛选等。
(2)药用及工业微生物的系统生物学与系统生物技术研究&产业化开发,主要涉及精细工程(precise engineering),药源性微生物资源库的构建与开发利用;翻译后修饰在菌种改良中的应用。
(3)新型能源与环境微生物的功能基因组学研究,主要涉及光合细菌生物制氢与环境污染治理、持久性污染物降解菌、健康和药物开发相关的应用微生物分子生态学与系统生物学研究。
教学与教材建设
教材与著作
《基因工程》(参编酵母表面展示,国家十五重点规划出版物,化学工业出版社2002)
《结核病实验诊断学》(人民卫生出版社2003年)
《神经科学进展》(第三辑,高等教育出版社2004年6月)
《药学细胞生物学》(第一版、全国药学院规划教材,医药科技出版社2006年1月,参编;)
《药学细胞生物学》(第二版,副主编2015年8月出版ISBN:978-7-5067-7446-8)
《DNA科学导论》(主译,排名第二,科学出版社2005年5月)
《微生物学》(副主编,科学出版社,2008)
《图解微生物学实验指南》(主译,科学出版社,2012)
《分枝杆菌分子生物学》(副主编,人民军医出版社2010)
《微生物分子诊断学》(参编,“分枝杆菌分子诊断”科学出版社2013年1月)
《实验结核病学》(参编“结核菌蛋白质组学”军事医学科学出版社2014年2月)
本科和研究生教学改革项目资助和获奖:
先后承担重庆市教委和西南大学多个本科教学改革项目,获得多个教学改革成果奖。
重庆市教育委员会研究生教改课题 “全球视野高层次人才培养的区域性跨院校支撑平台”(2012YJG123104)
重庆市教委研究生优质课程 “微生物学”负责人
西南大学首届教学成果贰等奖 “功能基因组学时代的《微生物学》教学与教材新框架研究(教材)”
西南大学第二届教学成果贰等奖 “理工农医等四学科核心基础课程《微生物学》实验新框架的研究和试点”
西南大学新生研讨课 “近现代生命科学史与大趋势”
发表研究生和本科生教学改革论文(中英文)
廖国建,谢建平.哈佛大学医学院研究生微课程项目及其启示.学位与研究生教育,2014,1:70-72
樊祥宇,何颖,谢建平. 以分枝杆菌噬菌体为例探索生命科学研究型教学.遗传,2014,36(8): 842―846
樊祥宇,廖国建,谢建平. 以CRISPR/Cas9 专利为例的知识产权教育.遗传,2014, 36(12): 1269―1273
Jakubowski,Henry, Jianping Xie(谢建平). An innovative and reciprocal undergraduate summer science exchange program between the US and China(创新和交互式中美本科生暑期科学交换项目). Council on Undergraduate Research Quaterly(本科生研究委员会.季刊),2007,28(1):12-17
发表科研论文:2008年-2015年10月18日之间,第一作者或者通讯作者发表或者接受论文100多篇,其中A1论文10篇,影响因子5分以上3篇。感兴趣者可以用 “谢建平”+“西南大学”,或者“xie Jian ping” AND "Southwest University"检索发表的所有文章。
教学授课
喜爱教书育人,作为政治辅导员时负责的本科生中,多位已经晋升教授、博导,指导的研究生也多位晋升高级职称。先后采用双语为本科生和研究生主讲《功能基因组研究方法学》、《微生物药物学》、《分子生物学》、《分子免疫学》、《微生物学》、《高级微生物学》、《微生物学进展》、《细胞微生物学》、《药用微生物功能基因组学》、《DNA科学》和《微生物生理学》等课程,授课主要采用《Science》、《Nature》、《Cell》等国际一流学术刊物最新原文和自编讲义。 根据国际学科发展前沿和动态,自编了以论文原文为主的讲义《功能基因组研究方法学》、《生物工程专业英语》,《微生物生理学》和《药用微生物功能基因组学》等。教学中注意培养学生的产业化和尊重知识产权意识,先后为生物工程、生物科学专业以及全校本科生开设了英文的《DNA科学》、《生物工程专业英语》、《遗传学》、《微生物学》、《免疫学》、《细胞生物学》、《生物技术的知识产权》和《高新技术产业化的知识产权保护》、《近现代生命科学史与大趋势》等通识教育和新生研讨课程。
《生活中的DNA科学》2013年和2014年分别入选重庆市和国家精品视频公开课/网易公开课,2016年1月开始建设SPOC(small private online course),数字化课程,以及网络学院通选课。
《生活中的DNA科学》 2014年获得国家大学素质教育精品通选课程。
生物医药知识产权领域的工作
2000年2月获得国家司法部颁发的“律师资格证书”。在以专利(生物制药、中药、化学合成药物)为主的生物医药有关的知识产权领域逐渐形成了自己的特色。作为中方专家组5个成员之一,主研了由法国外交部资助的中法合作研究项目《生物技术的法律问题》(2001-2004)。主要执笔完成上海市科技发展基金2001年重点软课题《生物医药领域的知识产权战略研究》(该报告获得中国科协特等奖,2005,上海市政府决策咨询奖2007)。在管理类和法学类核心期刊《研究与发展管理》、《政治与法律》等刊物上发表论文4篇。在《中国生物工程杂志》、《高新技术产业导报》等专业刊物发表生物医药知识产权文章近20篇。应邀在“2002北京国际生物医药知识产权研讨会”上作报告。2006年3月在中国药学会主办的“中国医药领域的知识产权保护学术研讨会”上作“基于生物序列的新型药物靶标产业化研发的知识产权保护”大会报告。
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